与普通的空调相比较，手术室净化空调多了抑尘、杀菌、驱味三方面的作用。
首先来看手术室净化空调安装的抑尘作用，因手术室内对于微粒子的高度洁净要求，抑制尘土是手术室首先要做到的洁净要求，这就要求手术室空调的气流要大于普通空调的气流，所以安装过程中应该做到：对于不同级别的手术室净化需要安装相应大功率的空调设备，以保障各个级别的洁净手术室的需要。
其次我们再来看看手术室净化空调的第二个作用——杀菌，这一作用对于手术室净化空调的要求极为重要，因为手术室对于无菌化的严格要求，直接关系到手术的术后患者的恢复，如果不能做好手术室的杀菌工作，很有可能导致患者术后伤口的感染。所以手术室净化空调安装必须有别于医院普通病房的空调安装，对空调进行严格的管控，以保障手术室随时可用。
最后我们说一下手术室空调的驱味作用，这一作用对于前两项作用是一个有益的补充，如果不能做到手术室空调的驱味作用也就无法真正从根本上做到抑尘与杀菌，因为之所以会有手术室异味就是源于手术室空气中的微尘与细菌，建议医院可以采用在通气管道中加一个独立的新风过滤器，在保障除尘的同时加大新风的洁净度。
以上介绍的手术室净化空调的安装设计方面的知识，只强调了功效方面的问题，但安装设计过程中还必须强调其性能方面的节能降耗。
